Всё начинается когда Кланы Хамато и Фут заключает перемирие, но Ороку Хирото внук Шреддера правитель Нью-Йорка в какой-то момент нарушает договор, напав и серьезно ранив Сплинтера.
Как умер Рафаэль
Черепашки и Сплинтер попали в засаду и скрылись в квартире у Эйприл, Сплинтер был очень тяжело ранен, в ярости Рафаэль выбежал из квартиры, он в своём стиле жестка сражался против всех из клана Фут Море крови в доках у причала, в конце концов он был втянут в поединок с лидером Ороку Караи. Рафаэль схватил её и сбил с причала, обе упали в воду. Когда Рафаэль нанес ей удар в спину своим саем, Караи ударила его катаром в горло… Так и умер Рафаэль. А Караи была спасена Футом и выжила, хотя и осталась в коме, Сын Караи Ороку Хирото поклялся отомстить.
Как умер Леонардо
После того как Ороку Хирото стал лидером клана Фут он вызывает клан Хамато для мирных переговоров. Сплинтер и Донателло направляются в Японию, когда они пролетели полмира в надежде заключить перемирие, Бакстер Стокман спланировал разрушительную атаку на оставшихся черепах и их союзников, Стокман выпустил казалось бы, бесконечное море летающих дронов, в тот момент стало ясно, Глядя на то, что казалось неизбежным поражением, Лео послал Микеланджело эвакуировать остальных и предупредить Донателло и Сплинтера, Лео и Кейси решили защитить своих друзей они хорошо понимали, что из этой битвы уже не вернуться. Какими бы благородными ни были их намерения, это не могло защитить их от неизбежной гибели. Стокман просто взорвал всю свою армаду дронов, вызвав мощный взрыв, убивший Лео и Кейси они погибли в результате взрыва, а Эйприл потеряла руку и ногу.
Как умер Донателло и Сплинтер
Донателло и Сплинтер прибыли в деревню Хамато, чтобы заключить перемирие с Ороку Хирото. Они собираются на кладбище, где Сплинтер недоволен, узнав что вместо него Хирото прислал своего посла. Посол Хару выражает свое неудовольствие тем, что клан Хамато принёс с собой оружие для мирных переговоров, но Сплинтер заверяет его, что это всего лишь церемониал.
Внезапно появляется Хирото, одетый в самурайские доспехи верхом на лошади он приказывает атаковать их, Сплинтер со своей стороны, ожидал предательства поэтому клан Хамато был вооружён. Но клан Фут намного превосходил их численностью, Хирото приказывает пешим лучникам выйти и начать осаду.
Сплинтер настаивает на убийстве Хирото, хотя Донателло предупреждают его о лучниках. Сплинтер бросает катану и попадает Хирото в горло, и лучники выпускают свои стрелы. Донателло движется перед Сплинтером, пытаясь защитить его, но они оба умирают под залпами стрел.
Как умер Микеланджело Ронин
Измученный галлюцинациями своих братьев, Микеланджело скитается по всему миру снежным горам по городам степям, в Японии он узнает как умер Сплинтер и Донателло от туда забирает с собой дневник учителя отца (Сплинтера), спустя много лет он готов сразиться с Ороку Хирото. В Битве Хирото проигрывает, но объявляет себя богом и взрывает свою броню, смертельно ранив Микеланджело. Кейси находит умирающего Ронина и говорит ему, что он оставил дневник. Микеланджело говорит, что оставил это для нее, и перелистывает последнюю страницу, показывая ей свой собственный урок, нацарапанный там который он называет «самым важным из всех». ЗНАТЬ МИР KNOW PEACE
